1）对于申请人而言
(1）申请手续简单:申请人只需要通过国际局使用一种指定语言（法语、英语或西班牙语)、提交一份申请、缴纳一次费用就可以向除原属国之外的其他所有加入相同条约的缔约方提出商标注册申请，不需要再委托其他国家的商标代理机构或组织办理，省去了向这些国家逐个申请注册的程序，也免去了分别向这些缔约方商标主管机关使用不同语言、提交不同申请、分别缴费的繁琐程序。
因此，对于申请人而言，商标马德里国际注册的手续非常简单。
(2）申请费用较低:商标国际注册的费用包含基础注册费、指定国家的费用、本国商标主管机关收取的费用三个部分。申请人可提交一份申请，在申请中指定一个或者多个成员国要求对其商标进行保护，而申请人只需缴纳一份基础注册费，指定的国家越多，缴纳的费用会更加合算。
因此，通过该体系申请商标国际注册比在各国逐一申请商标注册的费用更为便宜。申请的国家越多,费用节省得越多。例如，申请商标被注册在3个类别以内的，《马德里协定》或《马德里议定书》缔约方的基础费用均为100瑞士法郎，比绝大部分缔约方的国内申请实际费用要低。
(3）审查周期较短:如果商标国际注册申请人提交的申请材料齐备，缴纳了规定的费用，大约在6个月的时间内，国际局会颁发商标国际注册证明，并载明商标的国际注册号和国际注册日。该证明只表明国际局收到了国际注册申请，符合国际局审查的要求，已向或即将向各指定国提交审查申请，但各指定国能否核准该注册申请，要根据各指定国的审查来确定。
《马德里协定》及《马德里议定书》明确规定，商标注册申请在指定缔约方的审查驳回期限为，自通知日期起算的十二个月（注:适用于纯《马德里协定》缔约方及《马德里协定》和《马德里议定书》双缔约方)或十八个月（注:仅适用于纯《马德里议定书》缔约方)。大大缩短了商标审查周期，使得申请人能在更短的时间内确认自己的商标是否能在指定缔约方获得注册。
(4）维护管理便捷:申请人提出商标国际注册申请后，便可获得国际局颁发的国际注册证明，并获得对应的国际注册号。通过该国际注册号，可在世界知识产权组织网站上对自己所申请注册的商标指定的各个缔约方的审查情况进行查询，随时掌握商标在各指定国的最新进展同时获得官方文件，便于了解商标后续状态。申请人也可通过该国际注册号直接在国际局办理商标的后续事宜,比如变更、转让、续展、注销等。
因此，通过马德里体系申请商标国际注册使得申请人对自身的商标维护管理更为便捷。
2)对于缔约方商标主管机关而言
马德里商标国际注册体系最大优点是减少了缔约方商标主管机关的工作量。因为商标国际注册申请的形式审查部分是由国际局完成，而且国际局还负责国际注册公告的发行，以及收取和分配国际注册规费，所以，大大减少了缔约方商标主管机关的工作量。
