根据《商标国际注册马德里协定》《商标国际注册马德里议定书》以及《共同实施细则》，商标申请人通过国家商标局向国际局申请上报国际注册及办理其他有关申请的，应当按照相关规定向世界知识产权组织国际局缴纳费用。商标申请人应当自收到国家商标局缴费通知单之日起15日内，向商标局缴纳费用。期间未缴纳的,商标局不受理其申请，书面通知申请人。
国家商标局在收到整理齐全的申请文件，并确认无误后，进行申请日期登记录人，确定申请号，按照当日汇率计算瑞士法郎和人民币，并发出缴费通知,申请人或代理人应在收到费用通知之日起15日内向商标局缴纳有关费用。商标局只有在收到该款项后，才会向国际局递交申请。新申请马德里商标国际注册新申请费用由以下几部分组成:
(1）基础注册费:653瑞士法郎（黑白图样)或903瑞士法郎（彩色图样)。
(2）补充注册费:每个指定缔约方收取100瑞士法郎，要求单独规费的缔约方除外。
(3）附加注册费:在有补充注册费的情况下，如商品/服务的类别超过3个，每增加1个类别，增加100瑞士法郎。
(4）单独规费:某些缔约方会要求收取单独规费，详见下表。
（图片1）
（图片2）
注:①圆括号中数字为集体、证明商标收费标准。
②单独收费的标准不是固定的，国际局将根据汇率的变化或者应单独收费国因国内收费标准变化的要求及时将各国新的单独收费标准通知各成员国。
③日本申请费用为第一个类99瑞士法郎，每增加一个类增加75瑞士法郎，注册成功后收取注册费用每个类328瑞士法郎;加纳申请费用为每个类129瑞士法郎，注册成功后收取注册费用为每个类86瑞士法郎。
④表上没有列的国家均为3个类别以内100瑞士法郎。
(5）后续业务的收费标准:后期指定的基础注册费为300瑞郎，转让规费为177瑞郎（每个国际注册号)，变更规费为150瑞郎（每件变更申请)，删减规费为177瑞郎（每个国际注册号)，续展基础注册费653瑞郎，宽展费326.5瑞郎。放弃申请、注销申请、代理人名称或地址变更申请、指定代理人申请均免费办理。
(6）关于希腊单独规费收取的具体说明:
关于马德里新申请和后期指定，希腊知识产权局对超过第10个类别后不再要求收取额外的费用。举例说明如下:
如指定希腊时申请1个类别,单独规费为133瑞士法郎;如2个类别，单独规费为133+24=157瑞士法郎;
如10个类别，单独规费为133+24×9=349瑞士法郎;如申请的类别超过10个，单独规费仍为349瑞士法郎。此原则适用于集体商标。
关于马德里续展，希腊知识产权局对超过第10个类别后不再要求收取额外的费用。举例说明如下:
如续展涉及1个类别,单独规费为108瑞士法郎;如2个类别，单独规费为108+24 =132瑞士法郎;如10个类别，单独规费为108+24 ×9 =324瑞士法郎;如涉及的类别超过10个，单独规费仍为324瑞士法郎。此原则适用于集体商标。
(7）哥伦比亚:进入宽展期的商标，续展费每类加收278瑞士法郎。
(8）非洲知识产权组织:进入宽展期的商标，续展费加收238瑞士法郎。
2)后期指定马德里商标国际注册后期指定申请费用由以下部分组成:
(1）基础注册费:300瑞士法郎。
(2)补充注册费:每个指定缔约方收取100瑞士法郎，要求单独规费的缔约方除外。
(3）单独规费:某些缔约方会要求收取单独规费，详见单独规费表。
3）转让转让规费:177瑞士法郎（每个国际注册号)
4）注册人名称和/或地址变更变更规费:150瑞士法郎（每件变更申请)
5）删减商品/服务删减规费:177瑞士法郎（每个国际注册号)
6）续展续展申请费用由以下部分组成:
(1）基础注册费:653瑞士法郎。
(2)补充注册费:每个指定缔约方收取100瑞士法郎，要求单独规费的缔约方除外。
(3）附加注册费:在有补充注册费的情况下，如商品/服务的类别超过3个，每增加1个类别，增加100瑞士法郎。
(4）单独规费:某些缔约方会要求收取单独规费，详见单独规费表。
(5）宽展费:逾期未续展的，仍有6个月的宽展期，需加收宽展费326.5瑞士法郎。
7）汇率计算以国家商标局收文日的中国银行零点卖出价为准。
例如2013年8月1日的汇率为:1瑞士法郎兑换6.6374元人民币。
8）免费办理项目:放弃申请、注销申请、代理人名称或地址变更申请、指定代理人申请均免费办理。
