(1）欧盟商标注册对商标的显著性要求很高，欧盟28个成员国中只要一个成员国有人提出异议，且异议成立，将导致整个欧盟商标注册被驳回。尽管该驳回商标可以转换为国家申请，且保留原欧盟商标申请日，但申请人须另向每个国家支付转换费用。
因此选用商标的显著性不是很强的，则不适合申请欧盟商标注册。
(2）欧盟商标注册费用高。单独提交欧盟商标注册申请费用要高一些，但申请人也可以选择马德里国际注册指定欧盟,费用相对要低一些。
(3）欧盟商标注册时间不确定。在欧洲内部市场协调局申请商标注册的时间较难确定，如果一切顺利，商标可能在一年内获得注册。然而，只要有一个国家提出异议，该商标就不能及时得到注册，解决异议需花费很长的时间，通常需2年左右时间。在28个国家中均无异议的情况很少见，因此，欧盟商标申请往往在很长时间内不能获准注册。
